东升自然保护区的主要保护对象是内陆湿地生态系统。其担负着湿地生物多样性保护和湿地自然保护区有效管理的重要任务。
东升自然保护区地处三江平原腹地,具有比较典型的沼泽低湿平原的地貌景观。保护区的地质构造属同江内陆断陷的一部分。保护区水资源较为丰富,河流均为乌苏里江水系,挠力河、-通河、小挠力河等河流构成了该地区的主要地表水源。该区地处中纬度,属温带大陆性季风气候区。年平均气温3.6°C,全年活动积温2500—2700°C,无霜期146d,年平均降水量为503mm。
东升自然保护区的植物属长白植物区系。共有高等植物404种,分属69科。国家二级保护植物有野大豆、莲、乌苏里狐尾藻3种。保护区内有脊椎动物282种,国家重点保护兽类有雪兔和黑熊两种,国家Ⅰ、Ⅱ级保护鸟类有丹顶鹤、东方白鹳、大天鹅、鸳鸯等25种。
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