保护区内层峦叠翠,壑谷幽深,古树参天,涧水潺潺,沟谷地貌和岩溶地貌十分突出,多处形成槽谷、石笋、石钟、漏斗等千姿百态的岩溶奇观。区内的石灰岩区原始次森林是湖南省石灰岩地区海拔最低、植物种类最多的低山常绿阔叶林;有国内海拔最低的常绿阔叶林,最低海拔高度250米;有国内分布海拔最低且面积最大的桂花群落,海拔高度350—450米之间,最大面积约200亩;有国内分布海拔最低的伯乐树群落,海拔高度400—550米之间;在山脊和陡峭的岩面上有数百公顷保存完好的岩栎、乌冈栎和巴东栎组成的纯林。
保护区共有维管束植物2368种,隶属于206科,894属,其中蕨类植物38科85属311种,裸子植物7科19属28种,被子植物161科790属2029种。其中土著种子植物161科727属1934种。维管束植物科、属、种占湖南省维管束植物科、属、种比例分别为78.33﹪、61.27﹪、42.46﹪,其中属国家一级保护植物有珙桐、南方红豆杉、银杏、伯乐树4种;二级19种。区内有脊椎动物242种,其中属国家一级保护动物有白颈长尾雉、林麝等,其中白颈长尾雉为湖南首次发现地,且数量在国内为最多;二级保护动物33种。
区内丰富的野生动植物资源是人类不可多得的动植物基因库和宝贵财富。神秘的悬棺葬、浓郁的民族风情和独特的狃花文化与神奇秀美的借母溪自然风光构成了一部盛大的民族风情宝典,因此,有人称之为“湖南的九寨沟”,是生态休闲、科研考察的理想之地。
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